泵启动后，在离心力的作用下，吸水室中的剩余液体与进液管路中的空气被叶轮搅拌形成气液混合物，混合物通过蜗壳进入气液分离室，随着流速降低，导致气水分离，空气由泵出液口排出，液体经回流孔返回泵腔内，经过多次循环，进液管道中的空气被逐渐排空，使泵腔内形成一定的真空度。

　　低位槽中的液体在大气压的作用下流向泵进口，达到自吸的作用，这一系列的自吸过程是泵在刚启动的1至3分钟内自动完成，无需人工干预，当液体充满泵的进液管路与泵腔后泵组即自动进入正常运行状态。磁力自吸泵的驱动装置采用主动磁铁联轴器直接装在电机轴上，通过磁力偶合间接驱动转子组合上的叶轮旋转，泵腔全部封闭，完全无泄漏。